PyMOL 3.0.3 Windows 安装教程（附安装包）

PyMOL 软件是做什么的

PyMOL 是一款专业的分子可视化软件，广泛应用于结构生物学研究。它能够生成高质量的分子 3D 结构图，特别适合药物设计和蛋白质结构分析。相比同类工具，PyMOL 的操作更直观，渲染效果出色，是许多科研论文中结构图的常用制作工具。

PyMOL 安装包下载方式

为了方便大家下载，我已经给大家整理好了资源。资源链接放在下面，自取就好，如果链接失效，可以在评论区留言，我看到了会及时更新。

夸克网盘下载

下载好安装包后先解压，别急着双击！

PyMOL 安装步骤详解

1. 找到解压后的安装程序，右键选择”以管理员身份运行”。

2. 看到欢迎界面后，点击【Next】继续。

3. 阅读许可协议后，点击【I Agree】同意条款。

4. 安装选项界面保持默认设置，点击【Next】。

5. 安装位置使用默认路径即可，点击【Next】继续。

6. 准备就绪后点击【Install】，开始安装主程序。

7. 等待安装完成，整个过程通常不到一分钟。

8. 安装程序走完后，点击【Next】继续。

9. 打开 C 盘，找到 ProgramData 文件夹。若看不到该文件夹，需要在文件资源管理器上方菜单栏选择”查看”，并勾选”隐藏的项目”。

10. 进入 ProgramData 后找到 PyMol 文件夹，将安装包中解压出的两个文件复制进去，覆盖原文件。

11. 启动 PyMOL，首次运行需要导入 .lic 许可证文件。

12. 从开始菜单或桌面快捷方式打开 PyMOL。

13. 按提示上传许可证文件，成功后会有确认信息。

14. 完成以上步骤后，即可开始使用 PyMOL 进行分子结构可视化。

后续激活环节按软件弹窗提示操作即可。

PyMOL 使用注意事项

• 若软件启动后界面显示异常，可能是显卡驱动问题，尝试更新驱动，或在启动时按住 Shift 键选择软件渲染模式。
• 导入 PDB 文件后看不到分子，可在命令行输入 “zoom” 或按 Home 键让视图居中。
• Windows 11 用户遇到兼容性问题时，可右击 PyMOL 快捷方式，选择”属性”，在”兼容性”选项卡中勾选”以 Windows 10 兼容模式运行”。

常见问题

问：安装完成后如何让分子结构显示在窗口中央？

答：在命令行输入 “zoom” 或按 Home 键，即可让视图自动居中。

问：PyMOL 在 Windows 11 上运行不稳定怎么办？ 答：右击快捷方式进入”属性”，在”兼容性”选项卡中选择”以 Windows 10 兼容模式运行”即可。

问：界面显示异常通常是什么原因？ 答：多半是显卡驱动问题，可尝试更新驱动，或在启动时按住 Shift 键切换到软件渲染模式。